Вышинская пустынь была основана в начале XVII века по воле "Великой старицы", царицы-инокини Марфы Иоанновны, матери первого царя из рода Романовых - Михаила Федоровича. Особой милостью Божией к обители явилось дарование ей в 1827 году чудотворной иконы Пресвятой Богородицы, впоследствии получившей название Казанской Вышинской.
В 1812 монахиня одного из московских монастырей Миропия Данкова бежала в Тамбов от нашествия французов. На пути извозчик, пользуясь видимой беззащитностью монахини, задумал убить и ограбить её. Заметив его злое намерение, Миропия возопияла к Богородице, с иконой Которой никогда не расставалась, как со святыней и родительским благословением. Молитва была услышана, и как бы в ответ она услышала голос, от иконы исходивший: "Не бойся! Я твоя заступница". Извозчик пришёл в ужас и был поражён слепотой. Он тут же раскаялся и просил у Богородицы помилования, обещая доставить монахиню сохранно в монастырь. По усердной молитве он прозрел и довёз Миропию до Вознесенского монастыря. В 1827 Миропии было сновидение, в котором БР велела передать свою икону в Вышенскую пустынь. От иконы источаются благодатные исцеления и заступления в бедах.
В Вышинском монастыре с 1866 по 1894 год жил святитель Феофан, который написал множество книг, важных для понимания основ христианской жизни. Именно в эти годы Вышинская обитель становится, подобно Оптиной пустыни, одним из центров духовной жизни России. В XX столетии, во время начавшихся гонений на Церковь, злая человеческая воля превратила некогда цветущий монастырь сначала в свиноферму, а затем в психиатрическую больницу. Сейчас монастырь активно восстанавливается. Отреставрирован Успенский храм. В 2002 году произошло важное событие - Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Алексием II на свое первоначальное место были перенесены мощи чтимого во всем православном мире святого - святителя Феофана Затворника. Сейчас ведутся работы по восстановлению одного из значительных зданий монастыря - Казанского собора.
